If you're seeing this message, it means we're having trouble loading external resources on our website.

Ако си зад уеб филтър, моля, увери се, че домейните *. kastatic.org и *. kasandbox.org са разрешени.

Основно съдържание

Откриване на структурата на ДНК

Двойно-спираловидната структура на ДНК и как е била открита. Чаргаф, Уотсън и Крик, и Уилкинс и Франклин

Въведение

Двойната спирала на ДНК в днешно време е най-знаковата от всички молекули в биологията. Нейната форма вдъхновява стълбища, украси, пешеходни мостове (като този в Сингапур, показан на снимката по-долу) и много други обекти от популярната култура.
Моето мнение съвпада с това на архитектите и дизайнерите: двойната спирала е красива структура сама по себе си, нейната форма забележително съответства на функцията ѝ. Но тази двойна спирала не е била винаги известна на нашата култура. Всъщност тя остава неизвестна чак до 1950-те години.
Изображение: „Мост двойна спирала“ от Уилям Чо, CC BY-SA 2.0
В тази статия накратко ще се запознаем с откриването на двойноспиралната структура на ДНК чрез работата на Джеймс Уотсън, Франсис Крик, Розалинд Франклин и други изследователи. След това ще разгледаме свойствата на самата двойна спирала.

Компонентите на ДНК

Благодарение на работата на Фебус Левен и други изследователи учените по времето на Уотсън и Крик били наясно, че ДНК се състои от градивни елементи, наречени нуклеотиди1. Всеки ДНК нуклеотид е съставен от захарид (дезоксирибоза), фосфатна група и по една от четири възможни азотни бази: аденин (А), тимин (Т), гуанин (Г) и цитозин (Ц).
Базите Ц и Т, които имат само по един пръстен, се наричат общо пиримидинови, докато базите А и Г имат по два пръстена и се наричат пуринови.
Ляв панел: структура на ДНК нуклеотид. Деоксирибозата е прикрепена към фосфатна група и азотна база. Азотната база може да бъде всеки един от четирите възможни варианта: цитозин (С), тимин (Т), аденин (А), и гуанин (G). Четирите бази се различават по структура и функционални групи. Цитозинът и тиминът са пиримидинови бази и имат само един пръстен в своите химически структури. Аденинът и гуанинът са пуринови бази и имат по два пръстена в своите структури.
Десен панел: верига свързани ДНК нуклеотиди. Захаридите са свързани с фосфодиестерни връзки. Една фосфодиестерна връзка се състои от фосфатна група, в която два от кислородните атоми са свързани с други атоми - в този случай с въглеродните атоми на съседната деоксирибоза. ДНК веригата се състои от редуващи се фосфатна група и деоксирибоза (захарно-фосфатен гръбнак), като азотните бази са издадени настрани от деоксирибозните единици.
Изображения: отляво, изменено изображение по „Нуклеинови киселини: Фигура 1“ от колеж Оупън Стакс, Биология (CC BY 3.0). Отдясно, изменено изображение по „Химична структура на ДНК“ от Маделин Прайс Бол (CC0/обществено достояние).
ДНК нуклеотидите се сглобяват във вериги, свързани с ковалентни връзки, образувани между захарида дезоксирибоза на единия нуклеотид и фосфатната група на съседния. Тази подредба образува по дължината на целия ДНК полимер една верига от редуващи се захарид дезоксирибоза и фосфатна група – структура, известна като захаро-фосфатен скелет

Правилата на Чаргаф

Следващият ключ към загадката на структурата на ДНК е намерен от австрийския биохимик Едуин Чаргаф. Той анализирал ДНК на различни видове, като определил съотношението на азотните бази А, Т, Ц и Г в техния състав. Чаргаф направил няколко основни наблюдения:
  • А, Т, Ц, и Г не са в еднакви количества (както предполагали някои модели по онова време)
  • Количествата на базите варирали между видовете, но при индивидите от един и същ вид оставали постоянни
  • Количеството на базата А винаги било равно на количеството на Т, както и базите Ц и Г винаги били в еднакви количества (отбелязвано като А = Т и Г = Ц)
Тези изводи, наречени правила на Чаргаф, се оказват основополагащи за модела на Уотсън и Крик за двойната спирала на ДНК.

Уотсън, Крик и Розалинд Франклин

В началото на 1950-те години американският биолог Джеймс Уотсън и британският медик Франсис Крик показват своя известен модел на двойната спирала на ДНК. Така те стават първи в научното „надбягване“ за откриване на правилния модел на ДНК, в което участват и други – като Линус Паулинг (откривателят на вторичната структура на протеините).
Вместо да провеждат нови лабораторни експерименти, Уотсън и Крик предимно събирали и анализирали съществуващи данни, като ги подреждали по нови, изобретателни начини2. Някои от най-важните насоки за структурата на ДНК дошли от изследванията на химичката Розалинд Франклин, която работела в лабораторията на физика Морис Уилкинс.
Франклин била експерт в използването на една особено мощна техника за определяне на структурата на молекулите, известна като рентгенова кристалография. Когато кристализираната форма на молекула като ДНК се подложи на рентгеново лъчение, някои от лъчите се пречупват от атомите в кристала и образуват дифракционен модел, който подсказва структурата на молекулата.
Рентгеново дифракционно изображение на ДНК. Моделът на дифракция има форма на Х, съответстваща на двойноверижната спирална структура на ДНК.
_Изображение, модифицирано от "ДНК структура и последователност: Фигура 2," by OpenStax College, Biology (CC BY 3.0)
Кристалографските изследвания на Франклин предоставили важни насоки, с чиято помощ Уотсън и Крик откриват структурата на ДНК. Някои от тях идват от известното „Изображение 51“ – забележително ясно и впечатляващо изображение от рентгенова дифракция, получено от Франклин и неин студент (по-горе е показан съвременен пример за такъв дифракционен модел на ДНК). Като вижда Х-образния дифракционен модел на изображението, получено на Франклин, Уотсън веднага се сеща за спирална, двуверижна структура на ДНК3.
Уотсън и Крик са събирали различни данни, получени от голям брой изследователи (сред които и Фрин, Уилкинс, Чаргаф и други), за да сглобят своя известен модел на тримерната структура на ДНК. През 1962 г. Джеймс Уотсън, Франсис Крик и Морис Уилкинс получават Нобеловата награда за медицина. За съжаление по това време Франклин вече не е била между живите, а Нобеловата награда не се връчва посмъртно.

Моделът на ДНК на Уотсън и Крик

Структурата на ДНК според модела на Уотсън и Крик представлява антипаралелна, дясно въртяща спирала от две вериги. Захарофосфатните скелети на двете ДНК вериги образуват външната страна на спиралата, докато азотните бази се намират във вътрешността и се свързват помежду си в двойки с водородни връзки, които поддържат двете ДНК вериги свързани.
В модела, който е показан по-долу, оранжевите и червените атоми обозначават фостфатите от захарно-фосфатните скелети, докато сините атоми във вътрешността на спиралата принадлежат на азотните бази.
Анимация на тримерната молекулна структура на двойната спирала на ДНК.
Изображение: "Отрязък от B-форма на ДНК," от Jahobr, обществено достояние.

Антипаралелна ориентация

Двойноверижната ДНК е антипаралелна молекула: това означава, че се състои от две паралелни една на друга вериги, които обаче сочат в противоположни посоки. В двойноверижната ДНК началото на едната верига, наричано 5' край (завършващ с фосфатна група), стои до края на другата молекула, наричан 3' край (завършващ с хидроксилна група), и обратно.
Ляв панел: илюстрация на антипаралелната структура на ДНК. Показан е кратък сегмент от двойната спирала на ДНК, съставен от две вериги на ДНК, съединени чрез водородни връзки между азотните бази. Веригата в ляво има фосфатна група, открита при върха (5' края) и хидроксилна група, открита на дъното (3' края). Веригата вдясно има обратната ориентация, с фосфатна група, открита на дъното (5' края), и хидроксилна група, открита при върха (3' края). По този начин 5' края на една верига се озовава в непосредствена близост до 3' края на другата и обратно.
Десен панел: структурна формула на нуклеотид, илюстрираща 5' фосфатната група и 3' хидроксилната група. Тези групи се означават по този начин заради местоположението им в пръстена на дезоксирибозата. Въглеродните атоми в пръстена на дезоксирибозата се номерират от 1' (въглеродът, свързан с азотната база) до 5' (въглеродът, свързан с фосфатната група). 3' въглеродът в средата е свързан с хидроксилната група.
_Изображение, модифицирано от "ДНК химична структура," от Маделин Прайс Бол (CC0/обществено достояние)._

Дясна спирала

Според модела на Уотсън и Крик двете вериги ДНК се усукват една около друга, като образуват дясна спирала. Всички спирали притежават посока на въртене: това е свойство, което описва как техните извивки са ориентирани в пространството.
Изображение на двойна спирала ДНК, илюстриращо нейната дясна структура. Голямата бразда е по-широката празнина, която се движи спираловидно нагоре по дължината на молекулата, докато малката бразда е по-тясната празнина, която се движи паралелно на главната бразда. Двойките азотни бази се намират в центъра на спиралата, докато захарно-фосфатните гръбнаци се движат по протежение на външната страна.
_Изображение, модифицирано от "ДНК структура и последователност: Фигура 3", от Колеж ОупънСтакс, Биология (CC BY 3.0)._
Усукването на двойната спирала на ДНК и геометрията на азотните бази образуват една по-широка празнина (наречена голяма бразда) и по-тясна празнина (наречена малка бразда) по цялата дължина на молекулата, както е показано на фигурата горе. Тези бразди са важни места за свързване на протеини, които поддържат структурата на ДНК и регулират генната активност.

Сдвояване на азотните бази

В модела на Уотсън и Крик двете вериги в двойната спирала на ДНК са свързани помежду си посредством водородни връзки между азотните бази от противоположни вериги. Всяка такава двойка азотни бази е разположена в една равнина и образува „стъпало“ от стълбата на ДНК молекулата.
Двойките азотни бази не могат да включват произволна комбинация от бази. Напротив, има строга закономерност: ако в едната верига има база А, то тя задължително се сдвоява с база Т на съответното място в другата верига (и обратно). По аналогичен начин на всяка база Г от едната верига отговаря база Ц от другата. Това съответствие между А-Т базите и Г-Ц базите е известно като комплементарност на азотните бази.
Диаграма, илюстрираща сдвояването на азотните бази A-T и G-C. А и Т се намират една срещу друга на двете вериги на спиралата и техните функционални групи образуват две водородни връзки, които поддържат нишките заедно. По същия начин G и С се намират една срещу друга на двете вериги и техните функционални групи образуват три водородни връзки, които поддържат нишките заедно.
_Изображение, модифицирано от "ДНК структура и последователност: Фигура 3", от Колеж ОупънСтакс, Биология (CC BY 3.0)._
Комплементарността на азотните бази обяснява правилата на Чаргаф, тоест защо съдържанието на А-бази винаги е равно на съдържанието на Т-бази, както и еднаквите количества Ц-бази и Г-бази11. Когато има А-база на едната верига, винаги ѝ съответства Т-база на другата верига, и обратно. Същото важи и за Г и Ц. Тъй като голямата молекула на пуриновите бази (А и Г) винаги се балансира от малката молекула на срещуположните им пиримидинови бази (Т и Ц), то диаметърът на спиралата е постоянен и възлиза на около 2 нанометра.
Макар първоначалният модел на Уотсън и Крик да предполага по две водородни връзки между азотните бази на всяка двойка, днес вече знаем, че базите Г и Ц образуват още една допълнителна връзка (и така двойките А-Т се държат от по две водородни връзки, докато двойките Г-Ц са с по три)12.

Въздействието на двойната спирала

Откриването на структурата на ДНК отваря вратата към разбирането на множество аспекти от функцията на ДНК, например това как тя се копира и как информацията от нея се използва от клетката за производство на протеини.
Както ще видим в следващите статии и видеоклипове, моделът на Уотсън и Крик стартира нова ера на открития в света на молекулярната биология. Техният модел и откритията, които стават възможни заради него, полагат основите на много от съвременните новаторски изследвания в областта на биологията и биомедицината.

Разгледай темата извън Кан Академия

Искаш ли да научиш повече за ДНК стълбата? Виж това интерактивно изображение от LabXchange.
LabXchange е безплатна, научно-образователна онлайн платформа, създадена от факултета по изкуства и науки на университета Харвард с подкрепата на фондация Amgen.

Искаш ли да се присъединиш към разговора?

Все още няма публикации.
Разбираш ли английски? Натисни тук, за да видиш още дискусии в английския сайт на Кан Академия.